تأسس القسم بعد التقسيم الجديد للكليات في 2013. أين كان يندرج ضمن أقسام كلية العلوم والتكنولوجيا وعلوم المادة، والتي انبثقت عنها عدة كليات من بينها كلّية العلوم التطبيقية التي أصبح القسم ينتمي إليها، وهذا منذ مطلع السنة الدراسية 2013-2014. وهو بالاساس قسم فتي بالكلية، ويهدف هذا القسم إلى الإلمام والتأطير في كل ما يخص إنتاج ونقل واستخدام الطاقة الكهربائية بكل مستواتها.
قسم الهندسة الميكانيكية من بين لأقسام العريقة في جامعة ورقلة، ويعود تأسيسه إلى عام 1998