قسم الهندسة الميكانيكية من بين لأقسام العريقة في جامعة ورقلة، ويعود تأسيسه إلى عام 1998 أين كان يندرج ضمن أقسام كلية العلوم والتكنولوجيا وعلوم المادة، والتي انبثقت عنها عدة كليات من بينها كلّية العلوم التطبيقية التي أصبح القسم ينتمي إليها، وهذا منذ مطلع السنة الدراسية 2013-2014.

كلّية العلوم التطبيقية كلية فتيةٌ تشتمل على أربعة أقسام وهي، إضافة إلى قسم الهندسة الميكانيكية